Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lcn3Q62471 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lcn3Q62471 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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