Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp4Q62445 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms