Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ss18Q62280 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ss18Q62280 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ss18Q62280 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ss18Q62280 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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