Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sall3Q62255 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms