Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SspnQ62147 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SspnQ62147 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms