Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms