Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Odf1Q61999 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf1Q61999 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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