Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga7Q61738 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms