Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp4Q60972 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms