Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HellsQ60848 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HellsQ60848 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms