Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3Q60803 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms