Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf3Q60765 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf3Q60765 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms