Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms