Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clec4a4Q5YIR8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms