Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp20Q5XG71 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms