Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms