Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc125Q5U465 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms