Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms