Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms