Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk1Q5RJI5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brsk1Q5RJI5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Brsk1Q5RJI5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms