Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5431Q5NCB3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms