Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnni3kQ5GIG6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms