Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f8Q58FA4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms