Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms