Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spire1Q52KF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms