Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Znf827Q505G8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf827Q505G8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf827Q505G8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf827Q505G8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf827Q505G8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms