Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms