Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28bQ45KJ6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28bQ45KJ6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms