Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms