Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms