Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms