Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed1Q3V009 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms