Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms