Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaaf3Q3UYV8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms