Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms