Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms