Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms