Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ell2Q3UKU1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ell2Q3UKU1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms