Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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