Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Arfgef3Q3UGY8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arfgef3Q3UGY8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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