Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Garem1Q3UFT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms