Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm45902Q3UDN3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm45902Q3UDN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm45902Q3UDN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms