Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms