Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms