Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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LcorlQ3U285 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LcorlQ3U285 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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