Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms