Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms