Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms