Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms