Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms